Uniwersytet Mikołaja Kopernika jest 5. uniwersytetem i 10. uczelnią w Polsce według najnowszego Rankingu Szkół Wyższych, który opublikowały "Perspektywy".
Zestawienie uczelni przygotowywane przez pismo "Perspektywy" ogłoszone zostało 8 czerwca. Ranking Szkół Wyższych to w istocie cztery rankingi: Ranking Uczelni Akademickich obejmujący wszystkie (z wyjątkiem artystycznych) szkoły wyższe w kraju (publiczne i niepubliczne) posiadające uprawnienia habilitacyjne lub do nadawania stopnia naukowego doktora, Ranking Uczelni Niepublicznych Magisterskich, Ranking Państwowych Wyższych Szkół Zawodowych oraz Ranking Uniwersytetów.
UMK znalazł się na 5. miejscu w rankingu Uniwersytety 2016. W Rankingu Uczelni Akademickich 2016 zajął 10. miejsce. Pierwszą uczelnią w Rankingu Uczelni Akademickich 2016 jest Uniwersytet Warszawski.